Dispositif à faible coût conçu pour un test de variante de Covid 1 heure
Les chercheurs de Harvard et du MIT ont fait équipe pour prototyper un test de covidation diagnostique à base de salive autonome pouvant distinguer des variantes en une heure et «tout aussi précis que les tests de PCR maintenant utilisés», selon MIT.
C'est ce qu'on appelle "Misherlock", pour "Sherlock" minimalement instrumenté ", où Sherlock est un test ADN / ARN à base de crise inventé à l'Institut WYssS de Harvard pour l'ingénierie biologiquement inspirée.
Deux parties sont requises: des produits chimiques pré-emballés et du matériel réutilisable comprenant des composants électroniques courants et des pièces imprimées 3D. En plus de cela, il y a une application téléphonique optionnelle.
Selon l'Institut WYSS, l'appareil peut être assemblé pour ~ 15 $ (~ $ 3 produits de masse) et le test devrait coûter environ 6 $ chacun.
"L'une des grandes choses sur Misherlock est qu'elle est entièrement modulaire", a déclaré le chercheur au MIT Devora Najjar. "L'appareil lui-même est séparé des tests, de sorte que vous puissiez brancher différents tests pour la séquence spécifique de l'ARN ou de l'ADN que vous essayez de détecter. Les essais pour de nouvelles cibles peuvent être créés dans environ deux semaines, permettant ainsi de développer des tests pour de nouvelles variantes de SARS-COV-2 ainsi que d'autres maladies infectieuses. "
Il existe plusieurs étapes au test chimique (voir ci-dessous) et le matériel a été conçu pour les transformer en étapes simples pour l'utilisateur, qui crache d'abord dans un conteneur personnalisé via un petit entonnoir jetable.
TLe conteneur de saliva est poussé dans la première des deux chambres dans le matériel alimenté par la batterie, où l'échantillon est chauffé à 95 ° C pendant trois à six minutes alors qu'il réagit et s'imprécit dans un filtre.
C'est ce filtre qui entre dans la deuxième chambre, poussé par l'utilisateur avec un piston qui perfectionne également un réservoir d'eau, provoquant des produits chimiques Sherlock séchés pour réagir avec les particules de la surface du filtre. Plusieurs tests peuvent être effectués dans la deuxième chambre en même temps.
Une LED intégrée activée à 55 minutes plus tard, la liquide provoque la fluorescence du liquide si elle contenait covid-19 ou la variante spécifique de Covid-19 recherché par le package chimique. L'utilisateur "peut également utiliser une application smartphone qui l'accompagne qui analyse les pixels étant enregistrés par la caméra du smartphone afin de fournir un diagnostic positif ou négatif clair", selon l'Institut WYSS.
La biochimie
Sherlock (déverrouillage de reporter enzymatique enzymatique spécifique à haute sensibilité) utilise l'action de la "ciseau moléculaire" de CRISPR à l'ADN SNIP ou à l'ARN à un endroit spécifique, puis une seconde tâche si le premier a réussi
Pour ce test, une réaction Sherlock a été conçue pour la première fois comme un test de couverture permettant d'identifier un segment d'ARN de Covid-19 partagé par plusieurs variantes, puis de provoquer une fluorescence si cela réussit.
Les réactions de Sherlock ultérieures ont été conçues pour détecter Alpha, Beta et Gamma (Delta étaient rares pendant les mutations du projet de la protéine Covid-19 'Spike' séparément, indiquant de la même manière toute détection avec la fluorescence.
La salive est facile à collecter par rapport aux écouvillons de nez, c'est pourquoi il a été choisi, selon l'Institut, mais la salive a également des enzymes qui causent des faux positifs à indiquer.
L'étape de chauffage active des produits chimiques dans le récipient d'échantillon qui arrêtent ces enzymes fausses positives, ainsi que des produits chimiques qui ouvrent toutes les particules de virus Covid-19 de sorte que l'ARN viral puisse être piégé sur la surface du filtre spécialement conçu.
Testé sur 27 patients Covid-19 et 21 patients en bonne santé, selon Harvard, la version couverte de Misherlock a identifié 96% des patients de Covid-19 et 95% des patients sains. La version distinctive Alpha, bêta et gamma de l'essai a fonctionné sur des échantillons artificiels fabriqués à partir de salive sain et d'ARN viral synthétique à une gamme de concentrations.
Misherlock est décrit dans «Sherlock (Misherlock) minimalement instrumenté (Misherlock) pour un diagnostic de point de précaution sur les soins de SRAS-COV-2 et des variantes émergentes» publiées dans les avancées scientifiques et visible sans paiement.